编译 | 雪月

Addgene网站发表了一篇博客，汇总罗列了多个免费在线分子生物学相关工具网站，涵盖引物设计、质粒图谱、DNA序列**等。

质粒图谱

用于查看、编辑和制作质粒图谱。

SnapGene Viewer: 免费查看质粒图谱，付费可查看更多用于质粒设计的工具。

Benchling: 绘制质粒图谱，对学术用户免费。

Genome Compiler: 免费基于桌面的设计和绘制质粒的软件。

Serial Cloner:免费基于桌面的设计和绘制质粒的软件。

ApE (A pla**id Editor): 由犹他大学的M. Wayne Davis维护的工具，免费的，基于捐赠的质粒**工具。

DNA/蛋白质数据库搜索和**工具

Addgene's analyze sequence tool: 比对、翻译序列

NEBCutter2:查找酶切位点

Webcutter 2.0:查找酶切位点

Addgene vector database:质粒序列

NCBI BLAST:核苷酸或蛋白质序列比对

ExPASy translation tool: 翻译DNA序列

UniProt:蛋白质序列和功能信息数据库

Codon optimization tool:访问需要设置账号

引物设计工具

用于常规引物设计和一些应用于不同克隆需求的引物设计的站点

Primer3 and Primer3Plus:常规引物设计。

Design primers for Goldengate cloning

Design primers for In-Fusion Cloning

Design primers for Gibson Assembly and NEB HiFi DNA Assembly

OligoAnalyzer Tool from IDT: 用于发夹**，Tm值**以及引物二聚体**和其他引物特征。

克隆连接反应计算器

可以计算出不同类型的克隆**——restriction enzyme cloning, Gibson assembly, or In-Fusion cloning，所需的**序列和骨架的数量。

NEB Ligation Calculator: 该工具适用于任何克隆**。

In-Fusion cloning molar ratio calculator

实验室数学计算器

可以帮助进行实验室的常用计算问题。

Molarity calculator

Promega's Biomath Calculators

Primer resuspension calculator

DailyCalcs Science Calculator app for iPhone

每种工具网址请前往原文网站点击查看。

更多分子生物工具可查看https://labworm.com/

原文链接

https://blog.addgene.org/free-online-molecular-biology-tools?utm_campaign=cgdna_pilot&utm_content=133923458&utm_medium=social&utm_source=twitter&hss_channel=tw-82411462